A estrutura da UFU é assim composta segundo seu Regimento Geral: 

I. Conselho de Integração Universidade-Sociedade: órgão consultivo da Administração Superior.

II. Órgãos da Administração Superior: 05 Conselhos Superiores e Reitoria.

• Conselhos Superiores: órgãos de caráter consultivo e deliberativo. São eles:
  • Conselho Universitário
  • Conselho Diretor
  • Conselho de Graduação
  • Conselho de Pós-Graduação
  • Conselho de Extensão, Cultura e Assuntos Estudantis

• Reitoria: órgão de caráter executivo composto pelas unidades:
  • Vice-Reitoria
  • Pró-Reitorias
  • Órgãos administrativos
  • Órgãos suplementares (Hospitais)
  • Assessorias Especiais
  • Unidades especiais de ensino (Escolas de educação básica e de educação profissional)

III. Unidades Acadêmicas: órgão básico da UFU responsável pelas atividades de ensino, pesquisa e extensão. Elas podem ser Faculdades ou Institutos.

A atual estrutura organizacional está consolidada pela Resolução nº 01/2012 do Conselho Universitário - CONSUN. Em 2023, o organograma foi atualizado e divulgado conforme a Portaria REITO nº 401, de 01 de agosto.

O cadastro da estrutura organizacional da UFU nos principais sistemas oficiais é gerenciado pela Pró-Reitoria de Planejamento e Administração. Conheça mais sobre os requisitos e procedimentos para cadastro de unidades organizacionais nos devidos sistemas em http://www.proplad.ufu.br/servicos/estrutura-organizacional.